Wie op zoek is naar een verblijf met karakter en persoonlijkheid, vindt in Lissabon een ruime keuze aan unieke boutique hotels. Deze hotels combineren vaak historische architectuur met eigentijds design, zoals het Altis Avenida Hotel, een 5-sterrenhotel in een art-deco pand met uitzicht over de Taag. Andere opties, zoals het Neya Lisboa Hotel, bieden extra's als een spa en shiatsu-massagematrassen, terwijl het Hotel Acores Lisboa in de wijk Praça de Espanha een permanente tentoonstelling van Azoreaanse fotografie herbergt. De prijzen variëren van circa €100 tot €300 per nacht, afhankelijk van het seizoen en de ligging.
De beste wijken voor een verblijf in een boutique hotel in Lissabon zijn Avenida Liberdade - met het centraal gelegen Hotel Lisboa - en Chiado, waar het Altis Avenida Hotel op loopafstand van het bruisende Bairro Alto ligt. Ook de omgeving van Praça de Espanha (Hotel Acores Lisboa, Novotel Lisboa) biedt goede metroverbindingen en is rustiger. Veel van deze hotels hebben een uitstekend ontbijt, gratis wifi en een 24-uursreceptie. Het Novotel Lisboa is ideaal voor gezinnen, met een buitenzwembad en gratis verblijf voor kinderen tot 16 jaar. Boek tijdig, want unieke kamers zijn snel volgeboekt.